Это похоже на проблему вообще, а не конкретно смены пароля рута.
could not load ksh.
Проверьте, не повреждены ли файловые системы. проверьте целостность программных пакетов. Аппаратные ошибки.
Что делали до этого? Может быть, ставили что-то левое? Может быть, ОС криво обновилась?