Вариант 1: Запускаем обновление еще раз, т. к. вполне возможно, что какой-то пакет просто не поставился с 1-го раза.
Вариант 2: Берём с сайта IBM, откуда скачивали обновления, compare_report и сравниваем с тем, что имеем.
Что касается установки, то Вам, наверное, рекомендовали поставить второй диск, пока не поздно, а пока Вы раздумывали, время на таймаут закончилось и стало поздно. 😉
